Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip6Q9Z1Y4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip6Q9Z1Y4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms