Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms