Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stau1Q9Z108 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms