Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Skp2Q9Z0Z3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms