Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup160Q9Z0W3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup160Q9Z0W3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms