Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn13Q9Z0S4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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