Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcm1Q9R0L6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcm1Q9R0L6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms