Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrkQ9R0G8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms