Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plod3Q9R0E1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms