Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek3Q9R0A5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms