Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndrg3Q9QYF9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms