Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp1Q9QY53 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp1Q9QY53 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms