Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms