Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Homer2Q9QWW1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms