Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk1eQ9JMK2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms