Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Cabp1Q9JLK7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Cabp1Q9JLK7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Cabp1Q9JLK7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Cabp1Q9JLK7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Cabp1Q9JLK7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp1Q9JLK7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms