Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FancaQ9JL70 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.46■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FancaQ9JL70 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms