Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ldb3Q9JKS4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms