Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Uchl3Q9JKB1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uchl3Q9JKB1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Uchl3Q9JKB1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uchl3Q9JKB1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms