Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc12a4Q9JIS8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc12a4Q9JIS8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms