Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MkksQ9JI70 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MkksQ9JI70 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MkksQ9JI70 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MkksQ9JI70 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms