Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ush1cQ9ES64 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ush1cQ9ES64 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms