Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms