Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms