Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms