Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smco2Q9DA21 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smco2Q9DA21 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms