Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms