Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc3Q9D6Y1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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