Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ttc9bQ9D6E4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc9bQ9D6E4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms