Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sec23bQ9D662 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sec23bQ9D662 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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