Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930449I24RikQ9D5E3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms