Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc130Q9D516 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms