Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3404Q9D506 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3404Q9D506 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms