Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Phf6Q9D4J7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf6Q9D4J7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf6Q9D4J7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf6Q9D4J7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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