Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap53Q9D439 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap53Q9D439 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap53Q9D439 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap53Q9D439 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap53Q9D439 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap53Q9D439 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms