Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx29Q9D3S3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms