Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms