Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms