Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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