Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms