Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mdm1Q9D067 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms