Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Sgo1Q9CXH7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Sgo1Q9CXH7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sgo1Q9CXH7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sgo1Q9CXH7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sgo1Q9CXH7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Sgo1Q9CXH7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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