Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms