Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkrip1Q9CWV6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms