Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sycp2Q9CUU3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp2Q9CUU3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sycp2Q9CUU3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms