Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Atp6v0e1Q9CQD8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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