Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubl4bQ9CQ84 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubl4bQ9CQ84 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms