Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms