Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt88Q9CPR6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt88Q9CPR6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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