Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nup155Q99P88 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup155Q99P88 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms